| dc.contributor.advisor | Žurovcová, Martina | |
| dc.contributor.author | Slámová, Martina | |
| dc.date.accessioned | 2021-12-06T12:30:49Z | |
| dc.date.available | 2021-12-06T12:30:49Z | |
| dc.date.issued | 2008 | |
| dc.date.submitted | 2008-01-08 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/123456789/22825 | |
| dc.description.abstract | Testovali jsme použití molekulárního markeru COI pro při identifikaci druhů rodu Folsomia (Collembola). Marker byl úspěšně amplifikován a osekvenován. Dendrogram konstruovaný metodou Neighbor-Joining s modelem Kimura-2-Paremeter rozdělil testované jedince do očekávaných skupin a vysoká vnitrodruhová variabilita F. quadriocullatat ukazuje na existenci kryptických druhů.
Dále jsme získali 65 % mitochondriálního genomu F. candida, kde jsme identifikovali 16 genů pro tRNA, 9 genů kódujících proteiny a 2 geny pro rRNA. Pozice všech nalezených genů se shodují s pořadím zjištěným u G. hodgsoni, a jejich charakteristika se výrazně neodlišuje od ostatních mitochondriálních genomů zastupců řádu Collembola. | cze |
| dc.format | 33 s., 1 s. obr. příloh | |
| dc.format | 33 s., 1 s. obr. příloh | |
| dc.language.iso | cze | |
| dc.publisher | Jihočeská univerzita | cze |
| dc.rights | Bez omezení | |
| dc.subject | collembola | cze |
| dc.subject | Folsomia candida | cze |
| dc.subject | mitochondrie | cze |
| dc.subject | mtDNA | cze |
| dc.subject | COI | cze |
| dc.subject | barcoding | cze |
| dc.subject | sekvenování | cze |
| dc.subject | molekulární marker | cze |
| dc.subject | identifikace druhů | cze |
| dc.subject | collembola | eng |
| dc.subject | Folsomia candida | eng |
| dc.subject | mitochondrion | eng |
| dc.subject | mtDNA | eng |
| dc.subject | COI | eng |
| dc.subject | barcoding | eng |
| dc.subject | sequencing | eng |
| dc.subject | molecular marker | eng |
| dc.subject | species identification | eng |
| dc.title | Aplikace barcodingu na rod <i>Folsomia</i> (Collembola) a mitochondriální genom <i>F. candida</i> | cze |
| dc.title.alternative | Application of DNA barcoding on genus <i>Folsomia</i> (Collembola) and mitochondrial geonome of <i>F. candida</i> | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.identifier.stag | 3944 | |
| dc.description.abstract-translated | Mitochondrial molecular marker COI was tested for use in species identification of selected species of genus Folsomia (Collembola). Marker was succesfuly amplified and sequenced. Dendrogram constructed by Neighbor-Joining method with Kimura-2-Parameter model grouped all individuals into presumed species clusters and high intraspecific variability of F. quadrioculata suggests the existence of cryptic species.
Furthermore, 65 % of mitochondrial geonome of F. candida was obtained with 16 tRNA genes, 9 proteincoding genes and 2 rRNA genes identified. So far the genome characteristics correspond to the one described in G. hodgsoni. | eng |
| dc.date.accepted | 2008-01-30 | |
| dc.description.department | Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-discipline | Biomedicínská laboratorní technika | cze |
| dc.thesis.degree-grantor | Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Biologie | cze |
| dc.description.grade | Dokončená práce s úspěšnou obhajobou | cze |
| dc.contributor.referee | Marec, František | |
